首先是噪音問題。
研究及生產實踐都表明，氣流速度越高，所獲得的產品越細。當要獲得超細產品時，氣流的速度必須超音速。噪聲使人精力不能集中，注意力分散，往往易導致事故發生。由于氣流粉碎機本身結構特殊，對消聲器的結構設計提出了十分嚴格的要求。目前通常在出料口處接多級旋風分離器和大的除塵設備以及抽風機等輔助設備。
其次是超音速氣流粉碎機制造超細粉體的安全問題。
包括可能導致呼吸性塵肺病和粉塵爆炸。超音速氣流粉碎機碎樣所得的粉塵粒徑基本在5μm以下，對人體的危害最大。超音速氣流粉碎機碎樣操作者患塵肺職業病的幾率會明顯增加。同時粉塵大規模地散布于空氣中，還有可能發生粉塵爆炸。目前四川巨子粉體設備有限公司在氣流粉碎機安全防爆方面具有獨特技術優勢。
